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对标SnapGene!国内首款纯自主研发生物序列编辑器InSequence邀您使用
时间:2024-11-20 17:45:35 来源:微信公众号:Integle鹰谷
摘要 : 再次攻克“卡脖子”技术!由上海鹰谷信息科技有限公司纯自主研发

DNA/RNA/蛋白质序列编辑器是生物信息学领域中常用的工具,用于对生物序列进行编辑、修改和优化,这些编辑器帮助研究人员对生物分子进行精确的改造和修饰,例如对DNA和蛋白质序列进行编辑、分析和比对,也可以引物进行设计和分析,进行限制性酶切分析,以及进行质粒图谱绘制等操作,从而为许多重要的生物医学应用提供支持。


然而,目前科研中常用的DNA、RNA和蛋白序列编辑软件主要来自国外,如美国GSL Biotech LLC公司研发的SnapGeneLynnon Biosoft公司开发的DNAMAN、InforMax公司研发的BioEdit以及Premier公司开发的Primer Premier等。


由于研发技术难度大,专业壁垒高,交叉学科人才缺乏,市面上没有由中国纯自主研发,支持DNA/RNA/蛋白质的专业全功能序列编辑软件身影。


然而!今天!这一长期的“卡脖子”局面将被一款新的序列编辑器扭转!


上海鹰谷信息科技有限公司发布的纯自主研发DNA/RNA/蛋白序列编辑器鹰谷InSequence攻克分子生物学核心算法技术,对标SnapGene,实现序列编辑器科研软件的国产替代,拥有自主知识产权,简单易用,不仅免费!更是放心!


1.亮点功能


接下来就让我们一起来看看这款InSequence序列编辑器到底可以实现哪些功能吧,你想要的DNA序列编辑和设计、限制酶分析、序列注释和分析,InSequence全都能实现!


序列智能读取 高效便捷修改

兼容GenBank、Addgene文件中的序列信息,支持自动标注与手动修改特征、酶切位点、引物、开放阅读框等信息


引物快速设计  轻松精准分析

实时计算引物长度、Tm值、GC含量,高效设计引物,支持引物碱基的添加、删除与替换,一键插入常用蛋白质标签、酶切位点、密码子


特征可视标注  实时序列翻译

支持根据特征类型对序列进行标注、分段合并,实现特定的序列区域快速识别分析,支持自动翻译序列与翻译框架移动,快速分析特定的序列区域


序列协同处理  科研信息共享

支持收藏和管理多个序列、引物及酶组信息,支持与合作伙伴分享收藏夹内容,保持序列结构、引物、特征等信息的完整性和数据一致性



2.使用人员



无论你是生物学、生物工程和分子生物学等领域的科研人员,还是本科生、研究生以及教育机构的教师和学生,亦或是生物信息学、计算生物学和数据分析领域的研究人员,都可以使用InSequence来进行DNA/RNA序列的分析、比对和注释、序列编辑、设计引物、预测编码区域、高级序列分析、序列比对、基因预测和生物信息学等研究!


无论是初学者还是专业人士,InSequence都提供了易于使用和功能强大的工具,以满足用户在DNA/RNA序列分析、设计和研究方面的需求。通过提供免费的全自主产权软件,InSequence旨在促进国内生物科学研究的发展和创新。


3.使用说明


那么,我想使用这款强大的InSequence,应该如何操作呢?接下来就请跟随小鹰的脚步,来真实地感受一下InSequence的使用流程吧!


系统要求

InSequence 目前仅支持Windows操作系统,包括Windows 7、Windows 8、Windows 10和Windows 11等版本,请确保您的计算机系统符合这些要求。


下载与安装软件

您可以从InSequence官方网站上免费下载安装程序:https://www.integle.com/static/insequence


在安装过程中,用户需要按照向导的指示选择安装位置和其他选项,并点击“安装”按钮开始安装过程。安装完成后,您可以选择启动InSequence软件。



/ InSequence 成功安装流程 /


用户界面介绍

客户端版下载后,用户界面如下,可以新建或打开DNA、RNA及氨基酸序列文件。


新建或打开序列后,进入如下页面。包含标签页,一级及二级功能菜单,主界面及界面导航栏和底部信息栏。

您可在首页或编辑菜单下更改首选项的设置。



新建/打开和保存文件


新建:您可以在首页或文件菜单中点击[新建序列]来创建您的DNA/RNA序列,可自主选择序列类型,拓扑结构等。新建序列默认为InSequence DNA格式(.indna)。

打开:您也可在首页或文件菜单中点击[打开序列]打开序列打开已有文件。InSequence默认使用InSequence DNA格式(.indna),我们建议您将序列保存为此默认格式。当前版本能够兼容Fasta格式,GenBank格式和部分Snapgene格式,更多格式期待后续版本的更新。


导入:InSequence还支持从NCBI数据库中导入序列。输入NCBI数据库中的序列号并点击确认可自动下载相应的序列。


保存:可在文件菜单中点击[保存]或[另存为]保存当前文件。默认存储为InSequence DNA格式(.indna)。


浏览序列和编辑序列


序列视图和图谱视图:

用户可在主界面查看序列及图谱。视图共有三个选项(按照顺序):图谱-序列、序列、图谱,不同的视图可以鼠标点击左下角界面导航栏的标签进行切换。


在查看菜单下,您可以查看当前序列信息并按照您的个人习惯更改当前序列的显示选项,这一点与首选项设置的应用范畴有所不同。



酶组设置

您可以通过酶菜单下管理限制性酶,通过直观的查看序列的酶切位点来更好的进行接下来的质粒构建。


特征的显示和编辑

您可在特征菜单下对特征进行管理,完成新建特征、编辑特征、删除特征、查看特征、显示/隐藏特征、查看密码子频率等多项操作。

引物的显示和编辑

您可在引物菜单下对引物进行管理,完成新建引物、编辑引物、查看引物、显示/隐藏特征、收藏引物等多项操作,支持自主设置和修改引物的杂交参数。


序列的编辑

在编辑及右键菜单下,可自由编辑您的序列,进行复制、剪切、粘贴以及序列标记等多项编辑操作。


更多功能与更详细的使用细则,请前往序列编辑器界面的视频了解吧~

InSequence正在持续迭代升级中,欢迎大家提出新需求新想法,一起共创更好用的序列编辑器吧,

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